‘艾伦尤力克’是尤力克柠檬的一个芽变品种，结果性状优良，但冬季落叶严重，影响翌年产量，且其落叶的响应机制目前尚不清楚。为探究柠檬叶片脱落的分子调控机制，以2个冬selleck SB431542季落叶程度不同的柠檬品种‘艾伦尤力克’和‘云柠1号’为材料，分别于落叶前期（E24）、落叶中期（E48）和落叶后期（E72）采集叶柄离区，通过转录组测序比较2个品种间的差异表达基因。分析表明，E24、E48和E72时期分别获得1400、2466和935个差异表达基因，其中E48时期的差异基因数量最多。GO分析表明血红素结合、四吡咯结合、氧化还原酶活性、铁离子结合、转录调节活性等相关基因在3个时期品种间均表现出显著差异。KEGG分析Medical physics表明，E48时期富集的差异基因数及相关代谢途径最多，主要集中在植物激素信号转导、苯丙烷生物合成、植物病原体相互作用和MAPK信号通路-植物等途径，通过对4个通路的差异表达显著的基因进行分析，最后筛选得到木葡聚糖内转葡糖基酶/水解酶蛋白、吲哚乙酸诱导蛋白、吲哚-3-乙酸-氨基合成酶、过氧化物酶、β-葡萄糖苷酶、发病相关基因转录激活因子AP2和发病机制相关蛋白13个基因，这些基因可能与Bemcentinib溶解度柠檬叶片脱落的调控有关。以上结论丰富了柠檬叶片脱落相关研究，为柠檬落叶候选基因筛选、落叶途径解析提供可靠数据。