基于生物信息学分析纺锤体组装异常蛋白6同源物（SASS6）在肺腺癌发生和发展中的作用

背景:纺锤体组装异常蛋白6同源体(Spindle assembly abnormal protein 6 确认细节homolog,SASS6)的异常表达与某些癌症相关,SASS6在肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LUAD)中的作用尚不明确。方法:利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)等多个数据库,综合分析SASS6在LUAD中的表达及其与LUAD患者预后的相关性。分析SASS6在LUAD不同方面的caecal microbiota潜在生物学功能和共同特征,以及SASS6与LUAD免疫浸润细胞、免疫调节相关基因、趋化因子和受体的关系,探索SASS6在LUAD中的关键作用。结果:在TCGA和基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)数据库中,获得了31个肿瘤及其相应正常组织的SASS6表达数据。包括LUAD在内的22个肿瘤中SASS6表达升高,而在LUAD中SASS6甲基化水平降低。SASS6高表达是LUAD患者总生存期的危险因素。LUAD中SASS6表达水平与树突状(Dendritic cell,DC)细胞、CD8+T细胞等多种肿瘤浸润免疫细胞水平呈显著负相关。SASS6与LUAD中免疫激活相关基因、免疫抑制相关基因、趋化因子和受体的表达显著相关。结论:在LUAD中,SASS6的表达高于正常组织,这种表达升高可能与LUAD中SASS6甲基化PLX5622配制水平降低有关。SASS6是LUAD预后不良的危险因素,这种预后不良的作用可能与LUAD中SASS6的突变及其对肿瘤特异性免疫细胞浸润和迁移的抑制有关。