基于高通量测序筛选黄芪甲苷干预胃癌细胞的靶点及验证研究

目的 研究黄芪甲苷治疗胃癌的特异性靶点。方法 将人胃癌SGC-7901、HGC-27细胞分为空白对照组及不同质量浓度(40,80,120,160,200μg/mL)黄芪甲苷干预组,经四唑盐(MTT)比色法检测2组细胞增殖情况;对空白对照组及黄芪甲苷干预组(以120μg/mL黄芪甲苷处理48Bcl-2抑制剂 h后)SGC-7901细胞进行高通量测序;根据测序结果,以q-value<0.05、fold-change>2为条件,筛选空白对照组与黄芪甲苷干预组之间的差异表达基因,并通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)进行验证;将差异基因进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 高通量测序筛选出差异表达基因572个,包括238个上调基因和334个下调基因;富集分析结果显示,差异表达基因除了与代谢有关外,还与肿瘤相关信号通路(如甲状腺癌、小细胞肺癌、Notch信号通路等)有关;与空白对照组比较,以黄芪甲苷处理SGC-7901、HGC-27细胞48 h后,GPR98、GPR173、C1QTNF8immunity ability基因表达明显上调(P<0.05),ANAPC1、AMIGO3、CHEK2基因表达明S63845显下调(P<0.05),以上基因表达变化与测序结果一致。结论 黄芪甲苷可通过调节GPR98、GPR173、C1QTNF8、ANAPC1、AMIGO3、CHEK2等基因发挥抑癌作用。