序列相似家族135成员A的表达与结直肠癌的预后和免疫微环境关系

目的:探讨序列相似家族135成员A(FAM135)在结直肠癌中的表达及其与结直肠癌免疫微环境的关系。方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)下载结直肠癌及癌旁正常组织的基因表达及临床数据,分析CLCN3其在结直肠癌样本中的表达水平及与患者临床病理指标及预后的关selleckchem MK-4827系,采用配对样本t检验分析其表达差异检验分析其与相关临床病理指标的关系,Kaplan-Meier法分析其与预后的关系。通过基因本体(GO)生物进程分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析探讨CLCN3参与结直肠癌发生发展的可能机制,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)及Spearman相关性分析探索CLCN3表达与结直肠癌不同亚型免疫细胞浸润的相关性。结果:与正常组织比较,结直肠癌中CLCN3低表达(4.131±0.609比4.401±0.409,t=-3.105,P=0.002)。CLCN3的表达水平与肿瘤淋巴结侵犯(χ2=9.07,P=0.011)呈明显相关。CLCN3低表达与患者不良预后有关(χ2=6.41,P=0.011)。多因素分析结果表明CLCN3表达[风险比(HR)=0.654,95%可信区间(CI):0.441~0.970,P=0.035]为影响结直肠癌预后的独立因素。功能富集分析表明这些基因共涉及42个生物学过程,15种细胞成分和7个分子功能,这些基因CSF AD biomarkers主要参与味觉传导、系统性红斑狼疮、病毒致癌、mRNA剪接等通路。肿瘤微环境中免疫细胞相关性分析结果表明CLCN3表达与DC细胞(r=-0.279,P<0.001)、细SCH772984胞毒细胞(r=-0.212,P<0.001)、中性粒细胞(r=-0.206,P<0.001)、巨噬细胞(r=-0.099,P=0.002)等多种免疫细胞浸润相关。结论:CLCN3在结直肠癌中显著低表达,且与结直肠癌预后相关,可能作为结直肠癌的潜在预后标志物及治疗靶点。