本文以青海省大武乡(DW)、歇武镇(XW)、巴塘乡(BT)、杂多县(ZD)和称多县(CD)共5个地区的独一味(Lamiophlomis rotata)及其根际土壤为研究对象,分析土壤理化指标、土壤微生物群落、独一味类黄酮化合物含量、独一味类黄酮合成途径相关酶的基因表达,以及它们之间的相关关系。进一步探讨土壤因子、类黄酮合成酶基因表达对独一味类黄酮积累的影响调控机制。主要研究结果如下:(1)随着海拔的增加,独一味根际土壤过氧化物酶活性、纤维素酶活性基本呈增加趋势。土壤碱性磷酸酶活性、碱性蛋白酶活性、酸性蛋白酶活性、蔗糖酶活性、全氮含量、有机碳含量在中海拔(3860-3880 m)地区高于相对低海拔(3750 m)、高海拔(4207-4270 m)地区,相反土壤全钾含量在中海拔地区最低。结果表明除了酸性磷酸酶外海拔影响独一味根际其他土壤酶活性与土壤养分含量。(2)5个不同地区独一味根际土壤中共有细菌OTU875个,DW、XW、BT、ZD和CD中特异OTU分别为12、20、33、12和10;共有真菌OTU总数为88个,DW、XW、BT、ZD和CD中特异OTU分别为127、93、132、121和105。5个地区独一味根际土壤细菌群落中优势物种为Candidatus＿Udaeobacter、RB41属(RB41)、赤芍铁杆属(Ferruginibacter),真菌群落中MG132优势物种为被孢霉属(Mortierella)、寡囊盘菌属(Thelebolus)、地霉菌属(Geotrichum)。(3)独一味中类黄酮含量为5.94-12.94 mg/g,花青素含量为1.32-1.70 mg/g,芹菜素含量为0.42-14.49μg/g,儿茶素含量为1.24-5.94μg/g,木犀草素含量为0.12-1.08μg/g,槲皮素含量为0.48-0.99μg/g。随着海拔的增加,独一味叶中槲皮素与儿茶素含量基本呈增加趋势,根中花青素、槲皮素含量基本呈下降趋势。在独一味叶和根中,类黄酮含量变化趋势相同,但是槲皮素与木犀草素含量变化趋势相反。(4)随着海拔的增加,独一味叶中PAL、F3’H基因表达呈先下降后升高趋势,在ZD达到最低;但是4CL、CHS、F3H基因表达呈先增加后下降趋势,4CL基因表达在BT达到最高,CHS和F3H基因表达在ZD达到最高;叶中FLS、FNS、DFR基因表达在中度海拔(3860-3880 m)高于相对低海拔(3750 m)、高海拔(4208-4270 m)地区的基因表达。独一味根中FLS基因表达呈逐渐下降趋势,F3H基因表达呈逐渐增加趋势。独一味中CHS、F3H的基因表达量高且变化幅度大,表明独一味类黄酮合成途径中CHS、F3H基因起主要作用。(5)独一味类黄酮成分含量与土壤理化性质的相关性结果显示,呈显著正相关关系的有3组,分别为叶中花青素含量/p H值(p<0.05)、叶中槲皮素含量/土壤过氧化物酶活性(p<0.01)、叶中芹菜素含量/土壤酸性蛋白酶活性(p<0.05)。根中芹菜素含量/酸性磷酸酶活性呈显著负相关关系(p<0.05)。(6)独一味中类黄酮成分含量与细菌群落呈显著正相关关系的有2组,包括根中花青素含量/Terrimonas丰度(p<0.05)、根中木犀草素含量/uncultured＿bacterium＿f＿Gemmatimonadaceae丰度(p<0.05);呈显著负相关关系的有2组,分别为根中儿茶素含量/uncultured＿bacterium＿o＿Rokubacteriales丰度(p<0.05)、根中芹菜素含量/uncultured＿bacterium＿o＿Rokubacteriales丰度(p<0.05)。(7)独一味中类黄酮成分含量与真菌群落呈显著正相关关系的有8组,如根中类黄酮含量/Sebacina丰度(p<0.01)、根中芹菜素含Immune adjuvants量/Tetracladium丰度(p<0.01)、叶中类黄酮含量/Sebacina丰度(p<0.05)等;呈显著负相关关系的有3组,分别为根中芹菜素含量/Fusarium丰度(p<0.05)、叶中槲皮素含量/Clavulinopsis丰度(p<0.05)、叶中儿茶素含量/Helvellosebacina丰度(p<0.05)。表明独一味类黄酮化合物合成与真菌群落丰度关系较密切。(8)独一味类黄酮成分含量与基因表达的相关性结果显示,在独一味叶中呈显著正相关关系的有2组,分别为类黄酮含量/CHS基因表达量(p<0.05)、芹菜素含量/4CL基因表达量(p<0.05);在独一味根中,呈显著或极显著正相关关系的有6组,如类黄酮含量/ANR基因表达量(p<0.01)、儿茶素含LEE011分子式量/CHS基因表达量(p<0.01)、儿茶素含量/F3’H基因表达量(p<0.05)等。显示独一味根中类黄酮合成比叶中受较多基因表达调控。