基于加权基因共表达网络分析识别糖尿病肾病发展为终末期肾病的关键基因及免疫浸润分析

目的:利用生物信息学方法分析糖尿病肾病发展为终末期肾病的关键基因及免疫细胞浸润情况,探索糖尿病肾病进展的发病机制。方法:下载GSE142153数据集,在进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异基因表达分析后,通过基因本体(GO)进行基因功能注释和通路分析,筛选出糖尿病肾病发展为终末期肾病的关键基因及免疫细胞浸润分析。结果:通过GSE142153数据集获得差异表达基因164个,其中69个基因上调,95个基因下降。WGCNA分析共获得2个显著性模块。通过Cytoscape中用“cyto Hubba”插件分别对差异基因和关键模块中的基因相互作用的蛋selleck合成白进行分析,取交集后筛选出7个关键基因:CXCL2,TLR7,CCR2,CCL20,IL8,CXCL3,IL1β。通过对其进行受试者工作曲线发现联合7个基因的曲线下面积为0.916,具有良好的诊断效能。GO及KEGG通路分析提示免疫细胞及免疫反应在糖尿病肾病发展为终末期肾病中具有重要的作用,通过免疫浸润分析发现,终末期肾病患者血液中γδT细胞显著升高(P<0.05),而嗜酸性粒细胞显著降低(P<0selleckchem Emricasan.05),并且关键基因与免疫细胞具有明显相关性。结论:本文发现CXCL2,TLR7,CCR2,CCL20,IL8,CXCL3,IL1β这7个基因是糖尿病Trickling biofilter肾病发展为终末期肾脏病的关键基因。通过免疫浸润分析发现终末期肾脏病患者血液中γδT细胞显著升高,嗜酸性粒细胞显著降低,显示免疫细胞及免疫反应在糖尿病肾病发展为终末期肾病中具有重要的作用。