基于宏基因组学方法探究西北内陆河抗生素抗性基因赋存特征及其影响因素

抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的流行受到了国内外研究者的广泛关注,已有许多研究报道了 ARGs 在河流环境中的分布情况,然而关于西北干旱区典型内陆河中 ARGs 的研究甚少。本研究基于宏基因组学方法对 Y 河流域表层水中ARGs分布特征及细菌群落结构进行分析,探究了 ARGs 与环境因子、细菌群落间的关系。结果表明,Y 河流域表层水中检测到21种 ARGs 类型和 1295 种 ARGs 亚型,6 种抗性机制,多重耐药类为主要 ARGs 类型,macB为优势 ARGs ,抗生素外排泵为主要抗性机制;分别检测到160个门水平和4149个属水平细菌。变形菌门(Proteobacteria)是优势门,Liminohabitans等为优势属。相关性分析显示EC、TOC、DOC和COD_(MK-4827Mn)等与多种 ARGPR-171分子量s 亚型呈显著相关性(P<0.05);黄杆菌属(Flavobacterium)、单胞菌属(Polaromonas)和类诺卡氏属(Nocardioides)等部分菌属与多种 ARGs 显著相关plant synthetic biology,且涉及多种抗生素抗性类型和抗性机制。本研究以期为西北干旱区典型内陆河水环境ARGs分布特征提供数据支撑。