敲低CDCA8基因表达对膀胱癌5637细胞吡柔比星敏感性的影响

目的 膀胱癌具有较高的耐药和复发率,研究其分子机制有助于解决临床耐药问题。文中旨在探索CDCA8在膀胱癌5637细胞中的表达与吡柔比星(THP)敏感性的相关性。方法 收集2018年1月至2020年12月中南大学湘雅医学院附属海口医ABT-199浓度院膀胱癌组织患者的临床信息。从TCGA数据库中获取CDCNS nanomedicineCA8的mRNA表达数据及患者化疗信息,同时进行免疫组化实验,分析CDCA8的表达与患者化疗敏感性的关系。针对CDCA8基因构建RNA干扰慢病毒,将膀胱癌5637细胞分为空白组(未作处理)、阴性对照组(转染不含CDCA8靶序列的慢病毒)和实验组(转染含CDCA8靶序列的慢病毒,敲CL 318952低CDCA8),检测CDCA8基因及蛋白的表达;检测敲低CDCA8对膀胱癌细胞THP敏感性的影响;Celigo检测5637细胞吡柔比星IC50。结果 膀胱癌化疗者CDCA8表达(10.369±1.131)较非化疗者(9.250±0.892)显著高表达(P=0.012)。qRT-PCT实验结果显示实验组CDCA8的mRNA表达量(0.069±0.004)较空白组(1.087±0.075)、阴性对照组(1.001±0.054)显著降低(P<0.001)。免疫印迹实验结果所示,实验组CDCA8蛋白表达量较空白组、阴性对照组明显降低(P=0.003)。实验组的IC50明显低于空白组、阴性对照组(P<0.05),细胞抑制率显著高于其他两组(P<0.05)。结论 敲低CDCA8表达后增强了膀胱癌5637细胞对THP的敏感性,为后续研究膀胱癌THP耐药机制奠定了研究基础。

人源TNF-α蛋白生物信息学分析及相关治疗思路研究

目的 应用生物信息学分析软件预测并分析人源肿瘤坏死因子-α(TNF-α)蛋白结构和功能,并结合该课题组前期实验结果提出一些新的治疗思路。方法 利用在线Uniprot蛋白数据库、Expasy在线预测网站、SignalP-5.0、TMHMM Server V2.0、Cell-PlDinaciclib配制oc、SOPMA、SWISS-MODEL、在线数据库Protscale等生物信息学预测软件对人源TNF-α蛋白理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、空间结构及疏水性分析;登录“http://www.cbs.dtu.dk/services/netrhos/”网站对该蛋白磷酸化位点进行预测;选取String及IEDB等在线网站分析人源TNF-αSTM2457分子式的相互作用蛋白及该蛋白优势表位预测。结果 人源TNF-α蛋白为编码233个氨基酸的蛋白质,相对分子质量为26×10~3,为不太稳定的亲水性蛋白,有跨膜区,无信号肽;预测该蛋白亚细胞定位在细胞膜中,蛋白序列中存在15个丝氨酸磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;三级结构模型Medical practice显示该蛋白可形成同源三聚体,有多种蛋白与之相互作用。结论 生物信息学预测分析人源TNF-α含有多个磷酸化位点和B细胞优势表位,并且该表位与前期实验找到的功能性肽段序列相符,可为临床针对人源TNF-α设计多肽或药物提供新靶点。